Выпуск 597
Лаборатория Наномир
Когда реальность открывает тайны, уходят в тень и меркнут чудеса ... Из 3000 подписчиков рассылки около 100 человек уже подписали петицию! Это здесь: Петиция о господдержке лаборатории Наномир Открыты 23232(AGAGA)- и 12121-спирали Кушелева Проведём поиск по аминокислотной последовательности: AGAGA https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/19 … 9KMXFZN016 1 mlspgadarv sntgvttgsp edalgagaga gagagagaga gagagagaga gag https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/190684944# >ENA|ACE82623| gtgttatcgcccggcgccgatgcaagggtttccaatacaggcgtaacaacaggttctcctgaagatgcattgggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggtgcaggttga Locus ACE82623 FT CDS
1..162 gtgttatcgc ccggcgccga tgcaagggtt tccaatacag gcgtaacaac aggttctcct gaagatgcat tgggtgcagg tgcaggtgca ggtgcaggtg caggtgcagg tgcaggtgca ggtgcaggtg caggtgcagg tgcaggtgca ggtgcaggtt ga //
23232-спираль имеет примерно 2.7 аминокислотных остатка на виток. Полный комплект файлов: https://cloud.mail.ru/public/7mWB/YqHdS8y5r В одной белковой молекуле могут встретиться сразу несколько участков спиралей разных типов: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1150064138
Спираль 12121 здесь представлена очень хорошо. Интересно посмотреть её пространственную
модель...
В 12121-спирали на один виток приходится ~1.7 аминокислотного остатка 12121-спирали тоже бывают очень длинными: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/929747321?report=genbank&log$=prottop&blast_rank=6&RID=DDGPB4AU01R https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/929747320 >ENA|XP_014148644| atgggacctcagaggctcagactcacagccacagccacagtcacagtcacagtcacagcc acagtcacagtcacagtcacagtcacagtcacagtcacagtcacagtcacagtcacagtc acagtcacagtcacagtcacagttacagtcccagtcacagacactagtagaggactagag tctcagactccctcagagtctcagatgcagaactgcggcgaagggagacggtcgagaaag cctcacgcaggagagtgtctaagactcttagtgggtgggggtcacagactgagacagcct gacaagtga
Полный комплект файлов: https://cloud.mail.ru/public/2rbQ/1taz9qHr9 Обсуждение
Классические антигомологи барназа / barnase и биназа / binase Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2 Давайте посмотрим вторичные структуры классических антигомологов: биназа / binase и барназа / barnase: http://kpfu.ru/portal/docs/F1865063703/ … ournal.pdf
Найдём ген барназы по
куску нуклеотидной последовательности: CGGAAGAACGCCGAAAAACCTTACTAAGGAATTTCAATA https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/1173144?report=genbank&log$=nucltop&blast_rank=6&RID=DC7HB4U3013 >M14442.1 B.amyloliquefaciens
barnase gene, complete cds CTGGAAAACGTCACATTGCTTCCGCATATCGGGTCAGCAACGGCTAAAATCCGCTTGAATATGTTCACAC AAGCCGCTCAAAACATGATTGACGCCGTATACGGAAGAACGCCGAAAAACCTTACTAAGGAATTTCAATA AGAAGAAAAATCCCGGTTGGTTCAGCCGGGGTTTATTTTTCGCTAGATAAAAAGTACTATTTTTAAATTC TTTCTATTCCTTTCTTTCGTTGCTGATACAATGAAAAGGAATCAGCTTCACATGATGAAAATGGGAGGTA TTGCTTTGAAAAAACGATTATCGTGGATTTCCGTTTGTTTACTGGTGCTTGTCTCCGCGGCGGGGATGCT GTTTTCAACAGCTGCCAAAACGGAAACATCTTCTCACAAGGCACACACAGAAGCACAGGTTATCAACACG TTTGACGGGGTTGCGGATTATCTTCAGACATATCATAAGCTACCTGATAATTACATTACAAAATCAGAAG CACAAGCCCTCGGCTGGGTGGCATCAAAAGGGAACCTTGCAGACGTCGCTCCGGGGAAAAGCATCGGCGG AGACATCTTCTCAAACAGGGAAGGCAAACTCCCGGGCAAAAGCGGACGAACATGGCGTGAAGCGGATATT AACTATACATCAGGCTTCAGAAATTCAGACCGGATTCTTTACTCAAGCGACTGGCTGATTTACAAAACAA CGGACCATTATCAGACCTTTACAAAAATCAGATAACGAAAAAAACGGCTTCCCTGCGGAGGCCGTTTTTT TCAGCTTTACATAAAGTGTGTAATAAATTTTTCTTCAAACTCTGATCGGTCAATTTCACTTT
Аналогично найдём ген биназы по последовательности: GACGCAGGATTCGGAGCTGCGTCTTTTTATTTATTTCATCAGAAG https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/39499?report=genbank&log$=nucltop&blast_rank=2&RID=DC86XVSE016 >X53697.1 B.intermedius gene for
extracellular RNase (binase) GACGCAGGATTCGGAGCTGCGTCTTTTTATTTATTTCATCAGAAGGTTATCAGGAAAAAAGCCTCATTTT AGCAAAGAACCTGTTTCTTTACATTTCCTTCATGTTCGGGTGCTATAATATGAGGTAGACAAGCATCAAG AGGACAGCATCCGATTTCCTTAATAGGAGGATGAAGATGAAAAAAATCAGTTCGGTTTTTACTATGTTTG CTCTGATCGCTGCTATTCTGTTTTCTGGTTTTATTCCGCAGCAAGCCTATGCCGAAACACCTCTTACACA GACCGCCACAAATGAAACAGCTACTATTCAACTTACATCAGATGTTCATACCCTTGCCGTCATTAATACG TTTGATGGTGTAGCAGATTATTTAATTCGCTACAAACGATTGCCTGATAACTACATCACAAAATCACAAG CAAGTGCTCTTGGATGGGTGGCATCAAAGGGAAATCTAGCAGAGGTTGCCCCAGGTAAAAGCATCGGTGG AGATGTTTTCTCTAACCGGGAGGGACGTCTTCCTTCAGCAAGCGGCCGAACATGGCGTGAGGCAGATATC AACTACGTCTCTGGCTTCCGAAATGCTGACCGCCTCGTGTATTCAAGTGACTGGCTCATTTACAAAACAA CAGACCATTATGCAACTTTCACACGTATTCGATAATCAATCAAAAAACAGCCCCATTTGACGTAGGGCTG TTTTTTATGCTGCCTATGGC
А теперь сравним вторичные структуры:
Осталось построить правильные 3D модели этих классических антигомологов. Очевидно, что разная структура при практически одинаковой аминокислотной последовательности определена композиционным генетическим кодом. Locus M14442.1 B.amyloliquefaciens barnase gene, complete cds FT CDS 1..712 CTGGAAAACG TCACATTGCT TCCGCATATC GGGTCAGCAA CGGCTAAAAT CCGCTTGAAT ATGTTCACAC AAGCCGCTCA AAACATGATT
GACGCCGTAT ACGGAAGAAC GCCGAAAAAC CTTACTAAGG AATTTCAATA AGAAGAAAAA TCCCGGTTGG TTCAGCCGGG GTTTATTTTT CGCTAGATAA AAAGTACTAT TTTTAAATTC TTTCTATTCC TTTCTTTCGT TGCTGATACA ATGAAAAGGA ATCAGCTTCA CATGATGAAA ATGGGAGGTA TTGCTTTGAA AAAACGATTA TCGTGGATTT CCGTTTGTTT ACTGGTGCTT GTCTCCGCGG CGGGGATGCT GTTTTCAACA GCTGCCAAAA CGGAAACATC TTCTCACAAG GCACACACAG AAGCACAGGT TATCAACACG TTTGACGGGG TTGCGGATTA TCTTCAGACA TATCATAAGC TACCTGATAA TTACATTACA
AAATCAGAAG CACAAGCCCT CGGCTGGGTG GCATCAAAAG GGAACCTTGC AGACGTCGCT CCGGGGAAAA GCATCGGCGG AGACATCTTC TCAAACAGGG AAGGCAAACT CCCGGGCAAA AGCGGACGAA CATGGCGTGA AGCGGATATT AACTATACAT CAGGCTTCAG AAATTCAGAC CGGATTCTTT ACTCAAGCGA CTGGCTGATT TACAAAACAA CGGACCATTA
TCAGACCTTT ACAAAAATCA GATAACGAAA AAAACGGCTT CCCTGCGGAG GCCGTTTTTT TCAGCTTTAC ATAAAGTGTG TAATAAATTT TTCTTCAAAC TCTGATCGGT CAATTTCACT TT // Locus X53697.1 B.intermedius gene for extracellular RNase (binase) FT CDS 1..718 CGCAGGATTC GGAGCTGCGT CTTTTTATTT ATTTCATCAG AAGGTTATCA GGAAAAAAGC CTCATTTTAG CAAAGAACCT GTTTCTTTAC
ATTTCCTTCA TGTTCGGGTG CTATAATATG AGGTAGACAA GCATCAAGAG GACAGCATCC GATTTCCTTA ATAGGAGGAT GAAGATGAAA AAAATCAGTT CGGTTTTTAC TATGTTTGCT CTGATCGCTG CTATTCTGTT TTCTGGTTTT ATTCCGCAGC AAGCCTATGC CGAAACACCT CTTACACAGA CCGCCACAAA TGAAACAGCT ACTATTCAAC TTACATCAGA TGTTCATACC CTTGCCGTCA TTAATACGTT TGATGGTGTA GCAGATTATT TAATTCGCTA CAAACGATTG CCTGATAACT ACATCACAAA ATCACAAGCA AGTGCTCTTG GATGGGTGGC ATCAAAGGGA AATCTAGCAG AGGTTGCCCC AGGTAAAAGC
ATCGGTGGAG ATGTTTTCTC TAACCGGGAG GGACGTCTTC CTTCAGCAAG CGGCCGAACA TGGCGTGAGG CAGATATCAA CTACGTCTCT GGCTTCCGAA ATGCTGACCG CCTCGTGTAT TCAAGTGACT GGCTCATTTA CAAAACAACA GACCATTATG CAACTTTCAC ACGTATTCGA TAATCAATCA AAAAACAGCC CCATTTGACG TAGGGCTGTT TTTTATGCTG
CCTATGGC // Барназа / Barnase Биназа / Binase
Полный комплект файлов: https://cloud.mail.ru/public/3sny/irXs8nLti Обсуждение
34343(Q-спираль) и 14141(QVQVQ-спираль) в Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787 protein Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2 http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/AGA34115&display=text >ENA|AGA34115|AGA34115.2 Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787 hypothetical protein TTGACTCGGGCTTGGACTCGGGCTCGGGTTCCGGCTCAGGCTCGGGTTCCGGCTCAGGCT CGGGTTCCGGCTCAGGCTTGGGTTCCGGCTCAGGCTCGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGGCT CGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGCGGCTCGGGCTCCGGCTCCGGCTCCGG CTCCGGCTCCGGCTTCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGG TTCCGGCTCGGGCTCCGGCTCCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGGTTCCGGCTCGGAACCGAG TTGTGCGTTATCGATTTCGTCAGTGGTCGGCAGATCCTCGGGAGGAGCCGGGGGAAGCGT CAGGTCCCCCAGCTCGATCCAGCTTGCCTGCATGCCCCCGCGTCCGAGATCGAGGGTCGC CTGGCTCGCCTGCCAAACGACCAGACCGCCCACCGCGGCCCCGTGCAACGCGAGGCTCGC AAGAATCCCGAGCGCTAG
Locus AGA34115 FT CDS 1..498 ttgactcggg cttggactcg ggctcgggtt ccggctcagg ctcgggttcc ggctcaggct cgggttccgg ctcaggcttg ggttccggct caggctcggg ttccggctcg ggttccggct cgggttccgg ctcgggttcc ggctcgggtt ccgcggctcg ggctccggct ccggctccgg ctccggctcc ggcttcggct cgggttccgg ctcgggttcc ggctcgggtt ccggctcggg ttccggctcg ggctccggct ccggctcggg ttccggctcg ggttccggct cggaaccgag ttgtgcgtta tcgatttcgt cagtggtcgg
cagatcctcg ggaggagccg ggggaagcgt caggtccccc agctcgatcc agcttgcctg catgcccccg cgtccgagat cgagggtcgc ctggctcgcc tgccaaacga ccagaccgcc caccgcggcc ccgtgcaacg cgaggctcgc aagaatcccg agcgctag //
Полный комплект
файлов: https://cloud.mail.ru/public/2rbQ/1taz9qHr9 Обсуждение
Обнаружена гигантская (более 200
аминокислотных остатков!) Q-спираль (13131-спираль) Кушелева Пикомашины, которым больше миллиарда лет! https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/1111467114?report=genbank&log$=prottop&blast_rank=9&RID=DDGPB4AU01R https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1111466951 >ENA|CVL09568| atgacagaaggagtatcttcactagaagacattgccgcacaggttgaccgcggaagtctg cgtttgtgtgagtgtgcggttgtcaatgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtcactgtc actgtcactgtcactgtcactgtcactgtcagcctgacttgggtacagcaaaggctgttc tatcacgcacaacgcaaagaacccaattattctaaagaagaaaaatga Обнаружена гигантская (более 200 аминокислотных остатков!) Q-спираль (13131-спираль) Кушелева!
Locus CVL09568 FT CDS 1..768 atgacagaag gagtatcttc actagaagac attgccgcac aggttgaccg cggaagtctg
cgtttgtgtg agtgtgcggt tgtcaatgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac
tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac tgtcactgtc actgtcactg tcactgtcac
tgtcactgtc agcctgactt gggtacagca aaggctgttc tatcacgcac aacgcaaaga acccaattat tctaaagaag aaaaatga //
Чтобы понять, что это за конструкция, построим 3D модель.
Открыт белковый
пико-реактор!
Q-спираль по существу является реактором, состоящим из атомов азота... Давление в пико-реакторе
может быть даже больше, чем в современных прессах. Q-спираль может выполнять функцию "конвейера высокого давления"... Обсуждение
Уважаемые коллеги! Все, кто помогает создавать пикотехнологию, рубиновую энергетику, поднимает нашу цивилизацию на новую ступень развития. Всех нас можно поздравить с крупным
успехом. Эксперименты в США, Германии и в Израиле подтвердили, что мы находимся на верном пути по трём главным научным направлениям лаборатории Наномир.
По теме "Рубиновая/микроволновая энергетика и транспорт" осталось сделать последний шаг, включить готовые источники энергии. Конечно, с помощью магнетрона миллиметрового диапазона создать рубиновую энергетику можно за считанные дни, но для этого нужно доделать номинальный ряд эллипсоидов и рубиновый энергетический конструктор. Спасибо за поддержку!
Что нужно лаборатории для ближайших исследований: Skype, 2016-04-25: [12:51:45] Jocie Lee: Now we have round shape . the maximum size is 11mm [13:26:01] Jocie Lee: The price is 773 usd/pcs [13:30:11] Кушелев Александр Юрьевич: Thank You very mach! [13:31:24] Кушелев Александр Юрьевич: Do You have diamond box (color, for example yellow) 4x4x1mm ? If Yes, need price... [13:33:50] Кушелев Александр Юрьевич: And I need this forms: [13:59:46] Jocie Lee: oh...I am sorry. We dont sell
box [14:02:33] Кушелев Александр Юрьевич: OK! I wait money from my investors. I need 773usd/pcs diamond. [14:02:49] Jocie Lee: OK [14:03:13] Кушелев Александр Юрьевич: Do You make color diamonds? [14:04:50] Jocie Lee: I think this colorful stone is cubic zirconia [14:05:23] Кушелев Александр Юрьевич: But
I need color synthetic diamonds for science experiments :) [14:06:50] Кушелев Александр Юрьевич: I have cubic zirconia, but it has bad electromagnetic parameters. I need color synthetic diamond only. Your diamond size is very good!
1. Заказать алмазный энергетический конструктор. Минимальный заказ 773 USD + EMS доставка.
2. Оплатить покупку или аренду измерительной аппаратуры на диапазон от 4 до 32 ГГц. (От $1000). Идеальный вариант: http://www.keysight.com/en/pd-460865-pn-E8257D/psg-analog-signal-generator?&cc=RU&lc=rus 3. Начать третий этап создания средства для продления жизни: http://nanoworld.org.ru/topic/818/ Книга "Пикотехнология белков" уже в продаже!
Подробности
Менеджеры, которые найдут заказы на структуры белков, получат 80% от суммы заказа!
Приглашение к сотрудничеству
Лаборатория "Наномир" готова к взаимовыгодному сотрудничеству.
В одиночку внедрить технологии, выводящие цивилизацию на новый уровень, невозможно. Благодаря поддержке множества заинтересованных людей проделана огромная работа. Ознакомиться с её результатами можно изучив материал рассылки "Новости лаборатории Наномир". Люди науки могут изучить научные труды.
Вклад каждого не останется незамеченным в случае успеха в реализации научных проектов. Результаты совместной деятельности принадлежат участникам проекта пропорционально коэффициентам творческого и финансового участия.
Основные разработки:
Микроволновый источник энергии
Работы по созданию новой энергетики (микроволновой) ведутся с 1992 года.
В 2011 году были куплены рубиновые шарики для эксперимента на сумму ~1000 долл. Был проведен первый эксперимент в Дубне. В результате было сделано научное открытие, проверена защита диэлектрических резонаторов от перенапряжения. В марте 2016 года проведен первый этап эксперимента в микроволновой печи. Цель эксперимента - включение рубинового генератора. На первом этапе удалось возбудить рубиновый резонатор до уровня поверхностного пробоя, т.е. до
напряжённости 1000 000 вольт на метр. Цель следующего этапа - заставить рубин светиться.
Для завершающего этапа исследований по созданию микроволновой энергетики не хватает номинального ряда рубиновых резонаторов, который может быть изготовлен на китайской фабрике. Это стоит на порядок дешевле, чем качественная измерительная аппаратура миллиметрового диапазона.
"Регенерация репродуктивного возраста"
28 сентября 2011г. в Институте геронтологии (г.Киев) начался эксперимент по созданию "Регенератора репродуктивного возраста". В 2012-ом году мы уже знали, как омолодить лабораторных животных. Это было описано в 281-ом выпуске рассылки "Новости лаборатории Наномир. "Прожиточный минимум вампира"
В 2014-ом году американские ученые смогли реализовать этот вариант омоложения. Тем не менее мы ещё можем успеть первыми создать дешевый регенератор, возвращающий молодость, но для этого необходимо закупить праймеры для идентификации сигналов отключения феноптоза (механизма старения), как это делает эмбрион во время беременности. Если омоложение по-американски обойдётся
заказчику в 250-500 долл. ежедневно, то дешёвый вариант омоложения будет стоить всего 20-30 копеек в день.
Программа исследований Презентация Обсуждение
Пикотехнология
Созданы первые версии пикотехнологии (выпуски рассылки 212 270 271 272 ), с помощью
которой Александр Кушелев и Виктория Соколик сделали более10 научных открытий. Подготовлена к печати монография "Пикотехнология белков".
Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.
Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).
В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка.
Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.
Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структурном шаблоне Вашего белка.
Определены две структуры белка (пробный заказ) для Испанского заказчика.
В книге "Пикотехнология белков" приведены примеры 100 белковых структур.
Цена заказов -- договорная.
Сотрудничество может быть различным:
- участие в научных дискуссиях на форуме (конструктивное)
- совместное создание коммерческого продукта
- поиск инвесторов
- выступить менеджером по продаже готовых коммерческих продуктов
- конструктивные предложения по продвижению идей лаборатории Наномир
- содействие в проведении экспериментов и т.п.
- написание совместных научных статей и т.п.
- материальный вклад (денежный или обеспечение оборудованием и материалами)
Пожалуйста, сообщайте о своем вкладе, чтобы мы зачли Вас как партнера лаборатории Наномир.
+7-926-5101703, +7-903-2003424, +7-916-8265031, Skype: Kushelev2009, mail: kushelev20120@yandex.ru
веб-мани: WM-кошелек R426964799301 Другие способы перевода
|
|
|