Выпуск 585
Лаборатория Наномир
Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и меркнут чудеса ...
Обнаружена корреляция (местами 100%-ная!) между первичной и вторичной структурами белка.
Материал с форума лаборатории Наномир:
Кушелев: Уважаемая Виктория!
А Вы в курсе, что есть участки структуры белка, в которых первичная и вторичная структуры коррелируют на все 100% ?
Есть, например, аминокислоты Met (метионин) и Trp (триптофан), которые рибосома может поставить только под углом альфа-спирали, т.е. единственный вариант композиционного кода "1" 
Конечно, это может быть одиночный альфа-код или в составе спирали, но никак не код "2" или
"3" Если же из Met и Trp составлен участок белка более 3 аминокислотных остатков, например, -Trp-Met-Trp-Met-, -Trp-Trp-Trp-Trp-Trp- или -Met-Met-Met-Met- то это будет альфа-спираль однозначно.
А это означает 100% корреляцию первичной и вторичной структуры в этом месте.
Кстати, а что делать с фрагментами лизоцимов, о которых мы с Вами недавно беседовали? Вы нашли код человеческого лизоцима. Оказалось, что его фрагмент тоже замыкается, но не на 22-ом, а на 19-ом остатке.
Вероятность случайного замыкания фрагмента из 22 аминокислотных остатков равна 3^-21, а двух разных лизоцимов 3^-22*3^-18=3^-40 Вы верите в случайность найти иголку в стоге сена, размером с Солнце?
Фрагмент лизоцима куриного яйца, замкнутый через дисульфидный мостик.
Фрагмент человеческого лизоцима тоже замыкается на уровне композиционного кода:
Вы верите в две случайности подряд с вероятностями 3^-21 и 3^-18 ?
Виктория Соколик: Очевидно, что в этом случае будет синтезироваться спиральный виток, НО останется ли он после окончательного формирования функциональной конформации белка БОЛЬШОЙ вопрос.
Александр Кушелев: "Ломать не делать". Сломать можно не только молекулу белка, но и белковый кристалл разбить Главное, что рибосома формирует заранее известную структуру, альфа-спираль. Именно над
этим вопросом бились десятки тысяч молекулярных биологов прошлого века. А мы с Вами точно знаем, что участки белков -Trp-Met-Trp-Met-, -Trp-Trp-Trp-Trp-Trp- или -Met-Met-Met-Met- альфа-спираль однозначно. А что с ней потом сделают, это уже "другая песня".
Поэтому мне хотелось бы, чтобы Вы написали научную статью с изложением этого научного открытия. А заодно можно показать и фрагменты лизоцимов: http://nanoworld.org.ru/post/82424/#p82424
Ведь замыкание дисульфидных мостиков подтвердилось экспериментально, а случайное замыкание по коду имеет ничтожную вероятность.
Виктория Соколик: А что про эти участки ( -Trp-Met-Trp-Met-, -Trp-Trp-Trp-Trp-Trp- или -Met-Met-Met-Met- ) известно в PDB? Oни РЕАЛЬНО выявляются в составе спиральных фрагментов?
Александр Кушелев: С этими участками имеет смысл показать статистику в научной статье, а что касается "известно в PDB", то мы уже выяснили, что в случае фрагмента двух разных лизоцимов экспериментальное подтверждение есть. Если для научной статьи нужно больше примеров, то можно их собрать. Но даже двух примеров достаточно, чтобы получить достоверность "сорок девяток", т.е. 99.9999999999999999999999999999999999999%
Виктория Соколик: Лизоцим не имеет фрагментов ВТОРИЧНОЙ структуры, но это не отменяет его 3D-структуры в пространстве, которая закодирована и детерминирована в его гене.
Александр Кушелев: А почему мы не может сказать, что он имеет и вторичную структуру, только не альфа- или 310-спиральную, а вот такую, но конкретную:
Фрагмент человеческого лизоцима имеет на 6/18=33% альфа-310-спиральную вторичную структуру, на 1/18=6% бета-вторичную структуру, 11/18=61% пи-спиральную структуру
Фрагмент альтернативного человеческого лизоцима имеет на 5/21=24% альфа-310-спиральную вторичную структуру, на 2/21=10% бета-вторичную структуру, 14/21=66% пи-спиральную структуру
Уважаемая Виктория!
Я правильно понял, что белок с последовательностью -Trp-Met-Trp-Met-
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA168
ещё готовится к определению структуры? Если так, то может быть пошлём специалистам его вторичную структуру по программе Пикотех, чтобы они убедились, что мы заранее знаем структуру белка, который они только планируют исследовать?
Подробнее: http://nanoworld.org.ru/post/82434/#p82434
Виктория Соколик: Какой белок Вас интересует?
Александр Кушелев: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/767936528
Вот его вторичная структура полностью: https://img-fotki.yandex.ru/get/197756/ … f_orig.gif
***
***
По третьему белку информация здесь: http://nanoworld.org.ru/post/82432/#p82432
Виктория Соколик: Это по первому белку: http://www.uniprot.org/uniprot/Q3KP44#structure
Экспериментальных данных ещё нет. Сделали только модель:
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=4lg6
Александр Кушелев: Что-то я не могу найти последовательность аминокислотных остатков WMWM в этом белке: http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=4lg6
Может быть это не тот белок?
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/767936528
/translation="MMMRVGRHVYISQRQRASAILFMSWQESLSVTCRLWMWMTGHLC...
Вечные подошвы Будды для вечно-молодых...
С имплатнов у Вас очки и браслеты не свалятся, а микроволновые подошвы не сотрутся. Они вечные, поэтому нужны вечно-молодым...
На иллюстрации вместо Emdrive знатоки увидели "Вегу", т.е. преобразователь вращательного движения ротора в переменный электрический ток в обмотках, размещённых по кругу. Выходит, что статья Владимира Глушко - фейк?
Не будем торопиться с выводами. Для начала нужно ознакомиться с документами. Например, хотелось бы увидеть заявку на открытие под названием: «Явление электродинамического взаимодействия электрических токов проводимости с электромагнитной волной», которая по словам автора была подана в Комитет по делам и открытиям СССР 15 января 1973 года (см. заявку на открытие СССР, за № ОТ – ЕД – 319 , БС 35269 … от 15 января 1973г. автор – Глушко Владимир Павлович). Я сам не смог найти ни фотокопии, ни текста этой заявки, поэтому послал письмо автору с просьбой ознакомить с этой заявкой. Я не удивлюсь, если заявка действительно была подана и отклонена. Мы же видим, какое скептическое отношение вызвал доклад NASA и даже сообщения в прессе о китайских испытаниях Emdrive в космосе.
Кстати, я бы сформулировал заявку на открытие иначе: "Явление взаимодействия токов проводимости и смещения с эфиром Фарадея-Максвелла". Чего уж мелочиться? :) Резонатор рыбьей/змеиной волны (Microwave Engine / Emdrive) отталкивается от среды, эфира Фарадея-Максвелла, носителя электромагнитных колебаний/волн. Но "Явление электродинамического взаимодействия электрических токов проводимости с электромагнитной волной" по существу имеет тот же смысл. Так что о фейке говорить рановато. Пока это больше похоже на реальное научное исследование и реальную заявку на научное открытие.
Материал с форума лаборатории Наномир:
Diprospan: скорее всего вся ошибка этого текста:
http://att-vesti.neva.ru/J42-2-2.HTM
заключается в том, что верстальщик att-vesti.neva всунул не те две картинки (5 и 6).
Кушелев: Похоже на то. Причём пятая картинка может быть и правильная Подробнее
Skype:
[14.01.2017 6:12:20] Инвестор Пекшев: Когда летать начнём ???
[14.01.2017 9:40:17] Кушелев Александр Юрьевич: На днях
едем на завод договариваться об экспериментах по включению Ruby Emdrive:
Уважаемые коллеги! Все, кто помогает создавать пикотехнологию, рубиновую энергетику, поднимает нашу цивилизацию на новую ступень развития. Всех нас можно поздравить с крупным успехом. Эксперименты в США, Германии и в Израиле подтвердили, что мы находимся на верном пути по трём главным научным направлениям лаборатории Наномир.
По теме "Рубиновая/микроволновая энергетика и транспорт" осталось сделать последний шаг, включить готовые источники энергии. Конечно, с помощью магнетрона миллиметрового диапазона создать рубиновую энергетику можно за считанные дни, но для этого нужно доделать номинальный ряд эллипсоидов и рубиновый энергетический конструктор.
Спасибо за поддержку!
Что нужно лаборатории для ближайших исследований:
Skype, 2016-04-25:
[12:51:45] Jocie Lee: Now we have round shape . the maximum size is 11mm
[13:26:01] Jocie Lee: The price is 773 usd/pcs
[13:30:11] Кушелев Александр Юрьевич: Thank You very mach!
[13:31:24] Кушелев Александр Юрьевич: Do You have diamond box (color, for example yellow) 4x4x1mm ? If Yes, need price...
[13:33:50] Кушелев Александр Юрьевич: And I need this forms:
[13:59:46] Jocie Lee: oh...I am sorry. We dont sell box
[14:02:33] Кушелев Александр Юрьевич: OK! I wait money from my investors. I need 773usd/pcs diamond.
[14:02:49] Jocie Lee: OK
[14:03:13] Кушелев Александр Юрьевич: Do You make color diamonds?
[14:04:50] Jocie Lee: I think this colorful stone is cubic zirconia
[14:05:23] Кушелев Александр Юрьевич: But I need color synthetic diamonds for science experiments :)
[14:06:50] Кушелев Александр Юрьевич: I have cubic zirconia, but it has bad electromagnetic parameters. I need color synthetic diamond only. Your diamond size is very good!
1. Заказать алмазный энергетический конструктор. Минимальный заказ 773 USD + EMS доставка.
2. Оплатить покупку или аренду измерительной аппаратуры на диапазон от 4 до 32 ГГц. (От $1000). Идеальный вариант: http://www.keysight.com/en/pd-460865-pn-E8257D/psg-analog-signal-generator?&cc=RU&lc=rus
3. Начать третий этап создания средства для продления жизни: http://nanoworld.org.ru/topic/818/
Книга "Пикотехнология белков" уже в продаже!
Менеджеры, которые найдут заказы на структуры белков, получат 80% от суммы заказа!
Приглашение к сотрудничеству
|
