Когда реальность открывает тайны,
уходят в тень и меркнут чудеса ...

Как избавиться от старости и возрастных болезней?

У меня было две любимые бабушки. Я многое отдал бы за то, чтобы они с каждым днём становились моложе, а через год стали такими же молодыми, как мама и папа. Сегодня у меня нет ни бабушек, ни дедушек, потому что они умерли от старости. Но сегодня я знаю, как спасти от старости всех людей на нашей планете. Но "один в поле не воин", поэтому нужна хотя бы символическая поддержка самих дедушек и бабушек и тех, кому они дороги.

Эксперимент, который может дать гарантию вечной молодости стоит всего 2.5 тыс. долл. Давайте соберём эти деньги и отправим в Институт геронтологии НАМН Украины, где специалисты готовы бесплатно сделать 10 операций над лабораторными мышами, чтобы доказать существование гормона плаценты, отключающего программу старения. Если Вы готовы принять участие, сообщите об этом на форуме лаборатории Наномир. Вместе мы сможем омолодить планету...

За участие в этой программе вы можете получить подарок, если сумма вашей помощи больше 1000 рублей. Это или энциклопедия "Наномир" или цепочка Герона Александрийского на выбор. Как это сделать, смотрите в конце рассылки.

Регулярные вторичные структуры белков.

Программа "Пикотех" помогла обнаружить регулярные вторичные структуры белков, которые отличаются от тех, что перечислены в учебниках по молекулярной биологии...

Регулярный участок 149-154 (последовательность композиционных кодов 212121)

4 Раза повторяется последовательность композиционных кодов 311, т.е. 311311311311

Здесь же встречается любопытный структурный "перевёртыш":

Структурные (архитектурные) и акустические (музыкальные) перевёртыши.

Представьте себе, что Вам диктуют маршрут с поворотами через одинаковые расстояния:

Прямо, направо, направо, прямо, налево, прямо. А потом в обратном порядке: Кругом! Прямо, направо, прямо, налево, налево, прямо.

Куда Вы попадёте? Правильно, в исходную точку. Однако, на обратном пути нам приходилось поворачивать не только в обратном порядке, но и зеркально, т.е. если "туда" мы поворачивали направо, то "обратно" приходилось поворачивать налево.

Когда повороты происходят в трёхмерном пространстве, то движение по правой спирали "туда" означает и движение по правой спирали "обратно".

Что же даёт такое программирование структуры белка?

Начнём с того, что белок часто состоит из спиралей, причём не только с прямыми, но и с гнутыми участками. Гнуть и ломать альфа-310-спираль можно с определёнными ограничениями. Если же есть необходимость выйти за рамки этих ограничений, то кодируется архитектурный перевёртыш. Он позволяет проложить маршрут в пространсве для одиночной белковой цепи, а для того, чтобы укрепить её, и она стала той же прочности, что альфа-спираль, достаточно пройти тот же путь в обратном направлении. Для этого достаточно добавить в кодирующую последовательность триплеты в обратном порядке. Для этого надо всего лишь прочесть ДНК в противоположном направлении, что технически так же просто, как и в прямом. Таким образом, в программировании структуры белка используется реверсивное чтение ДНК/РНК с последующим закреплением удачных кодов-перевёртышей.

Мне удалось вручную свести прямую и обратную цепи архитектурного перевёртыша, и скоро мы увидим, как работает эта архитектура живого микромира...

Половина архитектурного перевертыша, участок прямой пи-спирали.

Архитектурный перевертыш. Антипараллельные участки прямой пи-спирали с одним поворотом на 180 градусов.

А как будут звучать перевёртыши, если и набор аминокислот будет переворачиваться? Тут уже идёт речь не об архитектурных, а о радикальных перевёртышах...

Понятно, что звучать будет вполне характерная музыка типа до ми соль соль ми до. Помните одно из произведений ансамбля Абба в этом духе? Сейчас попробую его разыскать...

Любопытно, что само название ансамбля ABBA - перевёртыш

А пока ищется запоминающееся произведение знаменитого ансамбля-"перевёртыша", давайте подумаем, зачем белковым молекулам нужны радикальные перевёртыши? Если половина радикального перевертыша может сформировать некое акустическое поле "аккорд", то вторая половина перевертыша может сформировать симметричное акустическое поле, а симметрия в акустике может оказаться очень полезной. Например, в стереосистемах появляется возможность определения направлений в пространстве. Мы уже знаем, что движение многих макромолекул направляется гиперзвуковыми сигналами. Теперь становится понятно, как реализованы "уши" молекул...

Радикальные перевертыши могут выполнять роль ушей для макромолекулы. Самые точные методы в современной измерительной технике - это методы сравнения. На принципе сравнения появились в своё время дифференциальные усилители, которые прочно вошли в электронику.

Оказывается, макромолекулы уже миллиарды лет используют метод сравнения для ориентации в живой клетке. Теперь понятно, почему одни молекулы плывут к рибосоме, другие к ядерной ДНК и т.д. Они запрограммированы на движение к источнику гиперзвука определённого спектра. При этом модификация молекулы позволяет переключать цели...

Многие биологически активные центры белка (и ДНК/РНК!) фактически подзывают к себе нужные макромолекулы...

Становится очевидным, что иерархия макромолекул в живой клетке работает по гиперакустическим командам. Младшие по званию молекулы подчиняются акустическим командам старших по званию...

Вероятно, идёт прослушивание на предмет незнакомых спектров. Если система защиты хорошо настроена, то макромолекул-чужаков, вероятно, отлавливают по гиперакустическому спектру, который не может на 100% совпадать с оригинальными спектрами.

Помните слова из сказки: "Твой голос на мамин совсем не похож..."

Оказывается, что эта ситуация может быть реализована на молекулярном уровне

Кушелев: У Аббы тоже было не всё гладко с комиссиями...

Цитата: В феврале 1973 года песня квартета Ring Ring, отвергнутая комиссией конкурса Евровидение, была записана на шведском, немецком, испанском и английском языках и возглавила чарты в Швеции, Австрии, Голландии, Бельгии и ЮАР. В марте 1973 вышел первый долгоиграющий альбом квартета под названием Ring Ring.

Кушелев: Ring в переводе на русский язык означает "кольцо"

Может сочинить песенку под названием Ring-Hedron ?

Кольцегранники отвергали в США, когда Кеннет Снельсон пытался выставлять модели атомов в музее. Отвергали их в России, сжигая тираж книги Протодьяконова и Герловина. Отвергают их и сегодня в "научных" кругах

Кстати, любопытно, может быть ансамбль Абба захочет вернуть молодость раньше других? Для них 2.5 тыс. долл. - пыль

И всё же вернёмся к нашим бара... простите, перевёртышам.

Итак, мы выяснили, что в мире живых молекул есть архитектурные перевёртыши, а так же радикальные перевёртыши. Первые являются перевёртышами маршрута, а вторые - перевёртышами, т.е. симметричными преобразователями акустического поля.

Могут ли акустические и структурные перевёртыши совмещаться? А почему бы и нет? В этом случае мы получим гиперакустическую "колонку" с двумя одинаковыми "динамиками", что может пригодиться для какой-нибудь задачи, хотя есть сомнения...

Другое дело, если одинаковые "динамики" или "микрофоны" расположены на достаточном расстоянии, чтобы пеленговать источники гиперакустических сигналов. Тогда получатся "уши".

Раздел пикотехнологии, который будет изучать нюансы обмена гиперакустическими сигналами в живой клетке, можно назвать "Ушастой пикотехнологией", но лучше, вероятно, подойдёт "пико-спектроскопия" или "пико-акустика".

Если уделить этому направлению должное внимание, то в ближайшее время мы можем смоделировать гиперакустическую обстановку внутри живой клетки. А это откроет нам не только глаза на то, что происходит в масштабах пикометров, но и уши ...

Мы сможем услышать язык общения живых молекул и попытаться его понять...

В своё время людям казалось, что рыбы немые, но позднее выяснилось, что они общаются между собой, но в ультразвуковом диапазоне частот. Теперь выясняется, что живые молекулы тоже общаются между собой, но в гиперзвуковом диапазоне. При этом одни молекулы слушают команды более старших по званию и выдают команды более младшим по званию...

Молекулы-рабочие распаковывают ДНК-программу, собирают по ней фабрику-рибосому и более старший по званию начальник начинает командовать собранным по команде молекулярным коллективом...

молекулы-рабочие живут всего несколько минут, но "всё идёт по плану" на протяжении миллиардов лет, правда планы иногда меняются

Кстати, о музыке. Вот Вам и басовый ключ микроволнового источника энергии

Перевёртыши в архитектуре...

LeoLine : Если на то пошло, то это - архитектурный недовёртыш , а вот настоящий и архитектурный, и перевёртыш

Кушелев: Любопытный орнамент микроволнового источника энергии...

Кстати, симметрия у него поворотная, а мы говорили о зеркальной, но, впрочем, это -мелочи.

Я заметил интересное окончание кодирующей последовательности белка NM_178131.3 за пределами CDS 79..2241:

CDS 1..100
tgcaa gttgataata ataatgaaaa gtataataaa actttaaaag
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa
//

Казалось бы, что эта последовательность не имеет отношения к структуре белка, но ... посмотрите, что мы видим. Пи-спираль из 7 аминокислотных остатков, затем код 1 (одиночный альфа- или 310-), после чего снова 7 аминокислотных остатков, затем код лизина aaa aaa aaa ... продолжает пи-спираль!

Интересно посмотреть на 3D-пикотехнологическую модель такого белка

Как видим, лизиновый хвост очень даже вписывается в структуру этого белка. Учитывая, что получилась гибкая гидрофобная пи-спираль, нетрудно догадаться, зачем белку понадобился этот хвост, и почему он кодируется за пределами очередного терминирующего кодона. Вероятно, в одних условиях хвост нужен, а в других нет, поэтому он и кодируется отдельно, т.е. "на всякий случай"

Книга Кеннета Снельсона "Силы становятся видимыми".

Kenneth Snelson. Forces made visible.

Теперь эта книга доступна в электронном виде на Яндекс-фотках.

Если что-то не прочтётся, то можно посмотреть здесь.

Новогодний подарок и одновременно вложение денег в развитие науки

15 января 2011 года планируется мощный эксперимент в Дубне. К этому сроку нужно изготовить 20 прецизионных рубиновых шариков из шариков-заготовок, заказанных на фирме Meller Optics, оборудовать рабочее место в новом помещении лаборатории Наномир. Приборы есть, но для проведения измерительных экспериментов их нужно разместить на стеллаже, а стеллаж нужно купить. Для шлифовки и сверления рубиновых шариков нужно изготовить новое оборудование. Для этого нужно миниатюрные двигатели, которые продаются на Митинском рынке и абразивы, которые продаются в магазине "Сапфир". Для контроля размеров рубиновых резонаторов нужны микрометры и пасаметры. Чтобы уложиться в жёсткий график экспериментов в Дубне нужно определить типы мод (число узлов стоячей волны, число пучностей вдоль меридиана и др. параметры) путём моделирования в программе HFSS. Для этого нужен компьютер с оперативной памятью не менее 8Gb, а лучше 16Gb. Таким образом подготовиться и провести эксперимент в Дубне сможете Вы, уважаемые читатели рассылки.

Мы предлагаем за помощь в подарок цепочку Герона Александрийского либо

энциклопедию "Наномир", если сумма больше 1000 рублей. Ну, конечно, если вы готовы этот подарок принять.

Подарки можем выслать по почте или вручить лично, например, в студии Ярослава Старухина на старом Арбате.